Η σχέση του Γιάννη Πλούταρχου με τη σύζυγό του, Μαρία, κρατάει χρόνια και από αυτή έχουν προκύψει πέντε παιδιά.
Ο δημοφιλής τραγουδιστής, ωστόσο, δεν χάνει ευκαιρία να δείξει την αγάπη του στη σύζυγό του, που το τελευταίο διάστημα φαίνεται πως έχει περισσότερο χρόνο να τον συνοδεύσει στις νυχτερινές του εξόδους.Σε βίντεο που αναρτήθηκε στο Instagram, ο Γιάννης Πλούταρχος παίρνει το μικρόφωνο και αφιερώνει τη μεγάλη του επιτυχία, «Αχ Κορίτσι μου» στη Μαρία Παπαδοπούλου, που κάθεται δίπλα του.Την ίδια ώρα, ο συνθέτης Κυριάκος Παπαδόπουλος, ο οικοδεσπότης του νυχτερινού κέντρου στον Πειραιά, όπου διασκέδαζε ο τραγουδιστής, ραίνει το ζευγάρι με αμέτρητα γαρίφαλα.
Πλάι στον Γιάννη Πλούταρχο και τη σύζυγό του διακρίνεται ο συνθέτης Αλέξης Σέρκος, ο άνθρωπος που υπογράφει τη μελωδία του τραγουδιού «Αχ Κορίτσι μου», που κυκλοφόρησε το 2001 μέσα από το άλμπουμ «Μικρές Φωτογραφίες».
Ο Γιάννης Πλούταρχος και η Μαρία Παπαδοπούλου έχουν αποκτήσει πέντε παιδιά, τον Γιώργο, τον Κωνσταντίνο, την Ελεονώρα, την Κατερίνα και την Παναγιώτα.